Более 1500 предметов находится в геологической коллекции музея.
Поделочные камни Алтая, кварцевые друзы, уникальные тумбовые образцы алтайского агата и нефрита.
А также железные, марганцевые, полиметаллические руды; руда на золото, серебро, медь; минеральное и строительное сырьё.